Pas ngjarjeve në Transformers: The Movie, Decepticonët janë arratisur dhe Autobotët kanë dalë fitues nën komandën e një lideri të ri, Rodimus Prime. Në mes të festimeve, Autobotët sulmohen, duke i bërë Decepticonët të duken si të dyshuarit kryesorë. Ndërkohë, Quintessonët misterioz përpiqen të fshehin një sekret të errët po aq të lashtë sa vetë Cybertron-i.
